Další díl ze série se vrací k jejím kořenům a klade velký důraz na individuální dovednosti. I proto je jedním z klíčových prvků tohoto ročníku systém „ID Player“. Ten se zaměřuje na co nejvěrnější ztvárnění jednotlivých dovedností a herního stylu nejlepších hráčů podle jejich reálných předloh.
Další inovací je plná kontrola nad zpracováním míče, přihrávkami a střelami díky systému „PES FullControl“. Díky ní získává hráč skutečnou volnost ve způsobu řešení různých herních situací.
Třetí důležitou ingrediencí je vylepšení umělé inteligence, při níž se vývojáři společně s fanoušky série pokusili odstranit problémové chování hráčů v některých situacích. Zvláštní pozornost byla věnována brankářům, jejichž pohyb je výrazně odlišný od ostatních hráčů. Celkově přispívá vylepšení umělé inteligence k reálnějšímu ztvárnění a lepší hratelnosti PES 2013.